【基因学苑】生物信息培训VIP课程-带源码课件
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【基因学苑】生物信息培训VIP课程-带源码课件
资源简介：
从该系列课程中精选一些生物信息分析中的常用技巧每一节课程很短，展示一个小技巧。
资源目录：
【基因学苑】生物信息培训VIP课程- 带源码课件
├──01生物信息入门
│ └──01生物信息入门.mp4
├──02Linux基础
│ ├──02Linux介绍.mp4
│ ├──03Linux基础.mp4
│ ├──04目录结构.mp4
│ ├──05文件操作1.mp4
│ ├──06文件操作2.mp4
│ ├──07编辑脚本.mp4
│ └──08权限和任务管理.mp4
├──03生物软件及数据库
│ ├──09生物软件简介.mp4
│ ├──10安装已编译软件.mp4
│ ├──11源代码编译.mp4
│ ├──12环境配置.mp4
│ ├──13bioconda.mp4
│ ├──14腾讯云安装软件.mp4
│ ├──15虚拟环境.mp4
│ └──16生物数据库管理.mp4
├──04illumina测序原理及数据处理
│ ├──17测序数据下载.mp4
│ ├──18了解测序这件事.mp4
│ ├──19illumina测序原理之建库.mp4
│ ├──20illumina测序原理之测序.mp4
│ ├──21fastq文件介绍.mp4
│ ├──22fastq文件处理.mp4
│ └──23数据质控和过滤.mp4
├──05pacbio测序原理及数据处理
│ ├──24pacbio测序原理.mp4
│ └──25pacbio数据处理.mp4
├──06nanopore测序原理及数据处理
│ ├──26nanopore测序原理.mp4
│ ├──27碱基识别.mp4
│ └──28nanopore数据处理.mp4
├──07解决软件报错
│ └──29解决软件报错.mp4
├──08新冠病毒数据分析
│ ├──30新冠病毒测序.mp4
│ ├──31下载新冠病毒基因组序列.mp4
│ ├──32下载新冠分析数据库.mp4
│ ├──33新冠病毒快速鉴定.mp4
│ ├──34新冠参考基因组拼接.mp4
│ ├──35新冠病毒拼接结果验证.mp4
│ ├──36拼接新冠病毒基因组.mp4
│ └──37ArticNetWork流程.mp4
├──09构建系统发育树
│ ├──38构建系统发育树.mp4
│ ├──39iTol美化系统发育树.mp4
│ └──40变种病毒识别.mp4
├──11拼接结果统计及评估
│ ├──46fasta格式文件介绍与处理.mp4
│ ├──47quast评估.mp4
│ ├──48busco评估.mp4
│ └──49tablet以及bandage评估.mp4
├──12基因组拼接探索
│ ├──50基因组拼接探索.mp4
│ └──51混合拼接.mp4
├──14基因组序列分析
│ ├──56原核生物基因预测.mp4
│ ├──57真核生物基因预测.mp4
│ ├──58基因功能注释.mp4
│ ├──59ncRNA分析.mp4
│ └──60重复序列分析.mp4
├──15序列比对
│ ├──61blast比对.mp4
│ ├──62blast使用案例.mp4
│ └──63全局比对.mp4
├──16共线性分析
│ ├──64共线性分析.mp4
│ └──65MCScanX共线性分析.mp4
├──17基因家族分析
│ └──66基因家族分析.mp4
├──18测序数据比对
│ ├──67测序数据比对.mp4
│ ├──68段序列比对练习.mp4
│ ├──69长读长序列比对.mp4
│ └──70多重比对问题如何处理.mp4
├──19sam和bam文件处理
│ ├──71sam和bam格式文件介绍.mp4
... 省略 153 行 ...
│ ├──222metawrap分箱.mp4
│ ├──223metawrap配置.mp4
│ └──224metawrap案例.mp4
├──54扩增子分析简介
│ ├──225扩增子测序简介.mp4
│ ├──226OTU还是ASV？.mp4
│ ├──227alpha和beta多样性.mp4
│ ├──228.16S分析环境搭建.mp4
│ ├──229metadata.mp4
│ └──230探索16S序列.mp4
├──55利用qime2分析16S数据
│ ├──231qiime2简介.mp4
│ ├──232qiime2导入数据.mp4
│ ├──233qiime2实战.mp4
│ ├──234多样性分析.mp4
│ ├──235物种分类鉴定及可视化.mp4
│ └──236不同组间丰度差异比较.mp4
├──56利用R分析16S数据
│ ├──237拆分barcode.mp4
│ ├──238利用dada2处理16S数据.mp4
│ ├──239dada2物种分类鉴定.mp4
│ ├──240dada2练习案例.mp4
│ ├──241利用phyloseq可视化结果.mp4
│ └──242.16S功能分析.mp4
├──57人基因变异检测
│ ├──243人基因组分析简介.mp4
│ ├──244全基因组与外显子和panel测序.mp4
│ ├──245参考序列的影响.mp4
│ └──246拼接与reads比对方法比较.mp4
├──58人基因组数据分析环境搭建
│ ├──247人基因组分析环境搭建.mp4
│ └──248瓶中基因组.mp4
├──61igv变异可视化
│ └──260igv变异可视化.mp4
├──10二代基因组拼接
│ ├──41了解基因组拼接.mp4
│ ├──42基因组拼接原理.mp4
│ ├──43kmer估计基因组大小.mp4
│ ├──44二代测序拼接算法.mp4
│ └──45二代测序拼接实战.mp4
├──13三代测序基因组拼接
│ ├──52pacbio及nanopore基因组拼接.mp4
│ ├──53组装结果纠错.mp4
│ ├──54细菌完成图.mp4
│ └──55不同物种拼接练习.mp4
├──46三代nanopore测序宏基因组数据分析
│ ├──197物种分类原理.mp4
│ ├──198centrifuge安装.mp4
│ ├──199centrifuge数据库.mp4
│ ├──201pavian结果可视化.mp4
│ ├──202物种分类练习.mp4
│ └──200三代测序宏基因组物种分类鉴定.mp4
├──48二代宏基因组测序数据分析
│ ├──207kneaddata质控.mp4
│ ├──208metaphlan物种分类.mp4
│ ├──209humann功能分析.mp4
│ ├──205二代宏基因组分析软件安装.mp4
│ └──206二代宏基因组分析数据库下载.mp4
├──50二代宏基因组拼接
│ ├──212二代宏基因组模拟数据拼接.mp4
│ └──213二代宏基因组真实数据拼接.mp4
├──51三代纳米孔宏基因组拼接
│ ├──215nanopore模拟数据拼接.mp4
│ ├──216nanopore宏基因组真实数据拼接.mp4
│ ├──217纳米孔组装纠错.mp4
│ └──214三代纳米孔宏基因组拼接.mp4
├──59二代测序变异检测
│ ├──249gatk简介.mp4
│ ├──250变异检测原理.mp4
│ ├──251生成bam.mp4
│ ├──252bam文件处理.mp4
│ ├──253gatk变异检测.mp4
│ ├──254外显子与panel数据分析.mp4
│ ├──255vcf文件.mp4
│ └──256snp注释.mp4
├──60三代纳米孔变异检测
│ ├──257纳米孔测序变异检测原理.mp4
│ ├──258纳米孔数据比对.mp4
│ └──259纳米孔测序SNP与SV检测.mp4
└──课件.zip
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